种子因素、气候原因、营养失调、栽植过深等均可能导致洋葱畸形。
种子原因：根据当地的温度及光照条件选择适合当地种植的洋葱品种。
气候原因：可采取大棚种植，加强温度管理，保证洋葱春化完全，促使鳞茎生长。
营养失调：合理施肥，前期以施加氮肥为主，中后期少施或不施氮肥，增施磷钾肥。
栽植过深：根据土壤情况合理调整栽植深度。
一、洋葱畸形的原因
1、种子原因
（1）洋葱栽培已久，品种较多，非常多地区在引种时没有参照当地的环境，导致种子和当地环境引起不适。比如冬性较弱的品种对于低温较为敏感，引种到年平均气温较低的地区，一遇低温就会抽薹；而冬性强的品种要感受到低温才会抽薹开花。
（2）防治方式：要选择适合当地环境的优良品种栽培，要根据品种对温度高低、日照长短反应，选择适宜当地种植的品种。
2、气候原因
（1）洋葱是典型幼苗春化型二年生植物，当幼苗生长到一定程度时，才会对低温有反应，如果在这个阶段内遇冷空气或气温偏低，就会导致幼苗由营养生长转向生殖生长。时间一长，就会发生春化而引起抽薹开花，气温过低，温度不可完全春化，引起鳞茎异常分化，造成生长畸形。
（2）防治方式：要加强管理，可以采用大棚方法，人为控制温度，使其春化完全，促使鳞茎生长。
3、营养失调
（1）在施肥时偏施氮肥、灌水过多时，就会导致幼苗徒长，抑制或延迟鳞茎的形成，在低温时期还会提前抽薹开花。而氮肥不足、土壤干旱时，幼苗生长细弱，提前进入到生殖生长，出现抽薹开花现象，也会导致鳞茎畸形。
（2）防治方法：施肥要合理，尤其氮肥的施用量要控制，前期施用氮肥，促进幼苗生长，但不宜过多，中后期要少施或不施氮肥，增施磷钾肥，能提高产量。
4、栽植过深
（1）在栽种过程中栽植过深或过浅，都会导致鳞茎生长异常或发育不良的现象，栽植过深，叶片生长过旺，鳞茎茎部增粗，鳞茎过小而畸形；栽植过浅，植株易倒伏，鳞茎还有可能会裸露地面，时间一长会变绿干裂。
（2）防治方法：栽植的深度一定要适宜，不宜过深或过浅，土壤疏松可适当深植，土壤粘重要适当的浅植。
二、洋葱从里面烂什么原因
1、洋葱从内部开始腐烂通常是由于患有洋葱软腐病、洋葱干腐病、洋葱颈腐病等病害导致的。
2、以软腐病和干腐病的病症为例：
（1）软腐病：鳞茎部染病后，初呈水浸状，向内部开始软化腐烂，散发出强烈的腐烂臭味。
（2）干腐病：收获期病株根盘部及鳞茎、根须均变褐枯死，地上部凋菱，鳞片间产生白色雾状物，自茎盘部往鳞茎内部腐烂。
