肥料施加过多：肥料施加过多，后续低温缺氧条件下肥料分解生成硫化氢、有机酸，致使水稻根系中毒。
温度过低：秧苗期间长期为低温天气，寄生菌或腐生菌侵袭秧苗根系，致使烂秧。
土壤透气不良：土壤透气性差或积水严重，导致水稻根系无法进行呼吸作用，最终根部腐烂。
药害肥害：除草剂或肥料使用不当引起药害或肥害，致使水稻根部腐烂。
病害：立枯病所致。
一、水稻根部腐烂的原因
1、田间使用肥料过多，后续肥料在低温缺氧的条件下分解，产生硫化氢、有机酸等多种有毒物质，导致水稻根系发黑，严重时，导致水稻根系死亡。
2、水稻秧苗生长期间，因为频繁遭遇低温，导致土壤中的寄生菌或者是腐生菌危害到秧苗根系，最终引起水稻烂秧。
3、稻田土壤透气性较差或者是稻田中长期积水，使得水稻根系部分没有办法获得足够的氧气，最终导致根系发黑腐烂。
4、除草剂或肥料使用不当引起的药害或者是肥害，有可能引起根部腐烂。
5、水稻感染立枯病，根系部位会有褐色霉层出现，严重时，还会导致根系部位腐烂。
二、水稻根部缺氧的原因
1、积水过多
（1）原因：土壤中的积水过多会导致水稻缺氧，是由于土壤渗入积水过多，使土壤完全处于水渍状态，形成封闭空间。特别是在雨天过后，非常多种植区域的排水功能较弱，或者是农户浇水不当，使稻田长时间处在积水的状态下。导致根部长时间浸泡在水里，没有办法进行呼吸作用，氧气含量也不足，导致水稻出现缺氧。
（2）防治：加强稻田的排水能力，合理浇灌，避免稻田积水过多，遇到连续阴雨天气，应该及时开沟进行排水，防止出现缺氧症状。
2、土壤原因
（1）原因：适宜水稻生长的PH值在7左右，当土壤中的PH值没有达到水稻生长所需，会影响根部的呼吸。并且当土壤偏酸时会导致土壤出现板结，土壤没有办法及时透气造成缺氧。主要是由于农户们追肥时没有注意合理使用肥料，过量的使用化肥或者是一些酸性肥料，导致土壤的有机物质含量降低，使土壤逐渐板结。土壤无水的时候其情况更加严重，水稻根部没有办法透气从而缺氧。
（2）防治：提高有机肥的施用比例，减少化肥的使用，对于已经偏酸性的土壤可以使用生石灰粉等碱性物质中和土壤酸碱性。定时进行中耕培土，增强土壤的通透性，加强根部的呼吸，提高土壤氧气含量。
3、环境不适
（1）原因：在连续阴雨天气后干旱或者是连续干旱天气后突然下暴雨，都会造成根部缺氧。特别是在春夏季的时候，在先雨后干的天气下，土壤在暴雨的天气会形成稀泥，然后经过太阳的直射，导致土壤变得很干硬。其密度也会增大，导致根部没有办法及时换气而缺氧，先干后雨情况则类似。
（2）防治：加强稻田的管理，定时对土壤进行中耕松土，降低土壤的密度，提高土壤通透性，促进根部的生长发育。
