茎基、嫩梢：茎基腐烂呈立枯状枯死或猝倒，嫩梢转变成深褐色并枯死。
嫩叶：病菌直接从嫩叶任何部位侵入，或沿着病枝梢及叶柄蔓延到叶片。发病初期时，出现暗绿色的水渍状小斑，后扩大呈灰绿色或黑褐色的近圆形或不规则形病斑。
一、柑橘苗疫病的症状
1、发病症状
（1）病菌从幼苗基部侵入，导致茎基腐烂呈立枯状枯死或猝倒。嫩梢发病，整条嫩梢变成深褐色而枯死。
（2）嫩叶发病，病菌直接从嫩叶的任何部位侵入，或沿病枝梢及叶柄蔓延到叶片，初为暗绿色水渍状小斑，后迅速扩大呈灰绿色或黑褐色的近圆形或不规则形病斑。病部长出白色的霉层，为病原菌的孢囊梗及孢子囊。
2、发病条件
（1）气候条件
该病以菌丝体在病组织中越冬，也可以以卵孢子在土壤中越冬，潮湿高温天气发病较重。
（2）品种因素
沙田柚、脐橙、椪柑易感病，而金桔、南丰蜜桔、早熟温州蜜柑及枳壳实生苗均较抗病。
（3）地形条件
①地势低洼，排水不良的苗圃病重，而建在缓坡 、排灌方便的苗圃病轻。
②平原水田苗圃病重，山地旱田病轻，连作易得病，轮作苗圃或新苗圃病轻； 密度过大，种植过密易感病；通风透气良好则不易感病。
（4）其它因素
在春季和秋季发病较为严重，其中以春、秋梢转绿期间发病迅速，老熟的枝梢和叶片较抗病。
3、防治方式
（1）注意选地设圃。应先地势较高、排灌方便、土质疏松的非连作地或非菜地作圃，播前及播后1~2周各灌注30%土菌消水剂1000倍液（3公升/平方米）1次。
（2）加强栽培管理。增施有机肥和磷钾肥，防止偏施过施氮肥；整治园圃排灌系统，注意清沟排渍，避免土壤过干或过湿。
（3）合理密植，定植深度和壅土高度要适当；苗地发现病株及时剪除病部并喷药封锁发病中心。
（4）及时喷药预防。在病害流行季节或有利发病的天气出现时，要加强巡查，一旦发现中心病株或发病中心，在剪除烧毁病枝基础上，及时喷药封锁。
（5）药剂可选用25%瑞毒霉、25%甲霜灵、64%杀毒矾可湿粉600-800倍液，或72%普力克水剂600-800倍液，注意轮用与混用、喷施与淋施、地上与树上喷施相结合，做到喷匀喷足。
二、柑橘酸腐病的症状及发生规律
1、症状
（1）多发生于成熟的果实，尤其是贮藏较久的果实。
（2）受侵染后，病部初呈水渍状软化，初期浅褐色，后转橘黄色，迅速扩大至全果腐烂。
（3）极度软腐，手触即破，流出酸臭汁液。病果表面或长出致密的白色霉状菌丝膜，此是病菌的分生孢子。
2、发生规律
（1）病菌为腐生菌，广泛分布于土壤中。分生孢子借风、雨或昆虫传播，采收时的工具接触也能传播。
（2）病菌需要相对较高的温度，15℃以上才引起腐烂，10℃以下腐烂发展非常慢。
（3）在高温密闭条件下，腐烂果的汁液流出并污染健果，可引起健果发病。
（4）一般，青果期较抗病，果实成熟度越高越容易感病。窖藏和薄膜袋贮藏发生较多，贮藏时间越长，发病越多。
（5）采后防腐保鲜用水不洁净，亦可导致贮藏期果实严重发病。高温、高湿、缺氧及伤口都有助于本病发生，刺吸式口器昆虫为害越烈，发病率越高。
