选购经过省级以上机构审定的品种，注意检查审定编号、推广种植范围，以及厂家的生产许可证、经营许可证等证件。
常规抗虫棉，原种的纯度要超过98%。杂交抗虫棉F1，纯度要超过95%，尽量避免使用杂交F2。
大种植户，最好选择1-2个当地的主推品种。适当挑选双价转基因抗虫棉品种，此类品种具有更好的抗虫能力，而且更加稳定。
一、选用棉花种子的原则
1、要选择经省级以上农作物品种审定委员会审定的品种。二要看清审定品种编号和界定的种植范围。三要看品种是否有生产许可证、经营许可证、检疫证。四常规抗虫棉原种纯度要达98%以上，杂交抗虫棉F1的纯度要达95%以上，尽可能选用杂交F1，不用杂交F2。五要对植棉面积较大的农户，引导他们选用1-2个当地主推品种。六要选用一定的双价（含两个抗虫基因）转基因抗虫棉品种，由于双价转基因抗虫棉抗虫性更加稳定、持久。
2、有些棉籽不适合做种子。感病严重的棉籽，枯、黄萎病是制约棉花产量的顽症之一，棉籽又是病菌的载体。因此，枯、黄萎病严重地区的棉种，不可调入感病轻的棉区，更不能调入无病棉区。
3、剥桃花的棉籽。有些棉农对发育较为的伏桃，仍然有抢墒剥桃花的陋习。凡剥桃花的棉籽，因为没有成熟，更没有完成后熟作用，不可推向市场。
4、喷施了乙烯利的棉籽。喷施乙烯利虽可促棉花早熟3-4天，但对棉籽损伤较大，致使发育不全，不能做种。
5、退化严重的品种。棉花是异交作物，异交率在8%左右，有些棉农多年不更换新的品种，棉种纯度只有70%-80%，继续使用必将导致减产。
6、与农药、化肥一起存放的棉籽。有些农户将棉籽与农药、化肥长期存放于一个仓库内，且通风不良，因为农药、化肥散发的有毒气体会损伤棉籽正常的生理，造成发芽率锐减。
7、储存年代过久的棉籽。棉种存放半年通常发芽率在80%以上，在无低温冷藏设备的情况下，棉种的寿命与储存年代呈负增长。
8、水泥晒场上晒过的棉籽。在水泥晒场上晒含水量较高的棉籽，因为棉籽呼吸强度旺盛，造成棉种生理机能失调，部分棉籽形成哑籽，失去发芽能力。
9、机械损伤过重的棉籽。精加工的包衣棉种中，机械损伤率应控制在2%以内。破籽率超过2%以上的棉籽，受浸染过重，对发芽率影响非常大，不宜于作种用。
10、伏前桃和晚秋桃棉籽。伏前桃和晚秋桃生长发育不良，成熟度差，铃重轻，种子发芽率低，长势脆弱。
二、棉花种子能不能直接播种
1、棉花种子通常可以直接种，但是直接播种的出芽率比较低，因此建议将棉花作催芽处理后再播种，能提高出苗率。
2、一般在播种前半个月可晒种3-5天，每天晾晒5-6个小时打破种子的休眠期，随后再把种子放入清水中浸泡5-6个小时，当种子外皮变软后再捞出并放在温度为25-30℃的环境中作催芽处理。
3、需注意为确保棉花的品质，需选择优质的棉花种子，要求种子饱满且无病害，而且在播种前还可用适量的杀菌剂拌种，降低病虫害发生的几率。
4、处理完毕后便可将种子播种在肥沃的土壤中，要求土壤表面平整无沟坎，表土细碎无大块且无杂物，在种植过程中还需做好除草、中耕松土、浇水施肥、整枝等田间管理工作，当棉花成熟后便可以进行采收。
