颜色：不同微生物的颜色有所不同，尤其是常见的霉菌，具不同颜色的分生孢子。
气味：杂菌气味通常表现为酸、臭、霉和氨味，而食用菌一般具有菇香气味。
培养料表面的拮抗线：平菇菌丝和杂菌的交界处通常会有一条白线，即拮抗线，后续可通过颜色、气味等条件识别哪一方为杂菌。
一、如何识别食用菌杂菌
1、从颜色上来识别：不同的微生物颜色是不同的，特别是常见的霉菌，具有不同颜色的分生孢子，这是简易区分的方法。
2、从气味上来识别：平菇菌一般都具有菇香味或杏仁香味。而各种杂菌都具有各自的气味，多数表现为酸、臭、霉和氨味，霉菌多为大同小异的霉气味，而酵母菌多呈酸臭味。其他产氨细菌则多表现为氨水味。
3、从培养料表面的拮抗线来识别：平菇菌丝和杂菌在生长过程中，两种菌丝的交界处，常出现一条洁白的白线，如同地图上的分界线，这条线就叫做拮抗线。通过这条线和接种部位、颜色、气味等条件即可识别哪一方是平菇菌丝，哪一方是杂菌，发生的杂菌是属于哪种类型。
二、银耳杂菌防治方法
1、净化菇房环境
经常清理环境卫生，并撒石灰粉。培育前菇房严格，杜绝污染源。
2、精选原辅料
棉籽壳、麦麸要求无结块、无霉烂变质，并置于烈日曝晒。栽培袋事前检测质量。
3、规范菌袋生产
培养料含水量不可超过60%，装袋上灶时限不能超过6小时，避免料变酸。要求保持100℃24小时，中途不降温。
4、坚持无菌操作
接种室彻底。选用合格剂，喷洒空间、架床和场地。
5、精选菌种
春季培育银耳菌种要求香灰菌丝强些，防止接种后遇低温退灰，影响长耳。
6、污染袋处理
受杂菌危害的污染袋应区别处理。轻度污染的采取套袋扎口的方式，控制蔓延，再接种。污染严重的破袋取料，加1%-2%石灰水拌匀，堆闷24小时摊晒，下次再利用。子实体被绿霉污染，应提前采收，并用pH值为8的石灰水澄清液涂擦耳基，控制蔓延。
