酵母菌、放线菌、丝状真菌等关键微生物会将鸡粪分解成无机物，其它参与分解的有益菌还包括光合细菌、乳酸菌、纤维分解菌等。
鸡粪发酵期间，微生物菌群会与它组成微生态系统，使得它的发酵速度变得更快。
夏季，鸡粪需经过2个月左右才能完成自然发酵。如果使用微生物发酵剂，则只需20天左右。
一、鸡粪被什么分解为无机物
1、鸡粪被微生物分解为无机物，其中起到关键作用的微生物主要有细菌、丝状真菌、酵母菌、放线菌等，包含纤维分解菌、蛋白分解菌、酵母菌、光合细菌、乳酸菌、除臭菌等多种有益微生物。在发酵过程中，微生物菌群以辅料为载体与鸡粪组成复杂、稳定的微生态系统，加速鸡粪发酵。
2、在夏天时，如果鸡粪采用自然发酵方式，发酵时间大约需要60天左右。如果鸡粪经过微生物发酵剂处理，发酵时间可缩短至20天左右。
二、鸡粪的自然腐熟方法
1、堆积：鸡粪想要自然腐熟的话，首先需要进行一定程度的晾晒，让水分进行蒸发，之后就可以把鸡粪堆积起来，然后覆盖上一层塑料膜，这样可以有效阻止在发酵期间，鸡粪中的水分过量流失，影响发酵的效果。
2、自然升温：鸡粪在发酵的过程中会自然的升温，在内部的温度达到75℃的时候就需要把鸡粪摊开进行降温，然后再重新进行堆积，一般只需要重复3-4次左右，鸡粪就基本发酵完成了。
3、腐熟：发酵的鸡粪还是需要使用塑料膜覆盖住，然后在塑料膜上打几个孔，每天还需要把塑料膜掀开进行通风。在半个月的时候翻堆一次，然后在继续堆沤半个月左右的时间鸡粪就完全腐熟了，可以作为肥料使用了。
